★第三十六话 リン·ミンメイ/林明美（超级系）
 
一条辉追着敌人进入MACROSS内，然后获得卡多鲁的帮助。辉的主要目的就是在3回合内赶到林明美所处之地，然后因为MACROSS的变形一同被卷入地下。接着是味方大量机体登场与敌增援部队周旋。
 
　
 
★第三十六话 ミス·マクロス/MACROSS小姐（真实系）
 
这一话的版图是和超级系一样的，但是比较短。林明美正在参加MACROSS小姐竞选时，天顶星人突然来袭，一条辉就独自一人与之对抗。在第二回合时死神高达和沙漠高达都会前来援助，等战斗结束后他们就能成为仲间。
 
　
 
★第三十七话 ジュピトリァン/朱比利特（超级系）
 
★第三十七话 木星からの逃亡者/从木星来的逃亡者（真实系）
 
这次的敌人乃是以V GUNDAM为主，其中卡狄吉娜是会冲向胡素并发动攻击的，此时如果选择“カテジナを击たない”可加一点熟练度。另外，让正树前去说得琉妮亦能提升熟练度。真实系的情况下，若将敌军的初期配置消灭后，帝国军的蕾比便会出场，最好在她气力值可达使用“最终地狱”之前收拾她。
 
　
 
★第三十八话 帝国の女王（超级系）
 
MACROSS到达木星圈后，古洛巴尔前去参见？？？帝国的女王，结果反被关押起来。布拉度就组织了一个营救小队，要在15回合内找到古洛巴尔被关押的地方。如果上一话有说得琉妮的话，她就会告之正确位置（地图最右方），并在正树的劝说下，琉妮加入队伍。能够成为伙伴的还有两人，那就是在第四回合内以NPC登场的希罗和特洛瓦，只要让卡多鲁与迪奥去说得即可。因为时间紧迫，所以大家要善用地图炮来节约时间。当行至右方时，蕾比就会出现，让隆圣去挡她两次攻击后，她就会再度头痛并要众人救她，但紧接着她又恢复“正常”，迅速离去。
 
　
 
★第三十八话 人类を导く者/引导人类的人（真实系）
 
MACROSS抵达木星圈后，与帝国女王的谈判破裂，而且还遭到了？？？军的袭击，并被他们潜入MACROSS内，其实敌人的目的乃是女王的女儿夏克蒂。这一关最重要的就是阻止敌人由地图上方脱出。因为刚开始只有WING GUNDAM和重装高达两台机体可供使用，所以比较吃力。我方援军是在第三回合登场，不过此时的敌人应该已离脱出口不远了，因此最好使用“加速”快速追击。战斗结束后，WING GUNDAM与重装高达正式加入队伍。
 
　
 
★第三十九话 终末への前奏曲/往终末的前奏曲（超级系）
 
★第三十九话 ファ－スト·コンタクト/第一次接触（真实系）
 
好不容易脱离木星，一条辉接到林明美的联系，与她一同驾驶着练习机外出游玩，结果撞见了宇宙怪兽（真实系的话变为天顶星人）。当然凭一条辉那架练习机是毫无作为的，所幸EXCELION出现在此宙域（真实系的话，辉会被四架敌机包围，但因为敌人并不会做出主动攻击，所以还是不要无谓地挣扎），且第三回合时主角和骷髅中队赶过来，缓解了危机。超级系的话，味方在第七回合时还会有增援。此时，天顶星人突然将辉抓了去，于是主角、骷髅中队以及末沙他们也急忙追了过去。
 
　
 
★第四十话 ビッグ·エスケ－プ/大逃亡（共通）
 
众人被关在天顶星人的母舰内，对方对于地球人男女共处而备感惊讶，于是《超时空要塞》的经典场面再现，以接吻来吓退天顶星人（此时选择“カイフンがキスをする”会提升熟练度，而且一条辉也不会被带走），不过也因此明美和凯风被带至别处。接着，众人伺机逃脱，要在六回合内到达走出母舰。因为回合限制的比较严格，所以还是不要贪图经验值，直接往地图下方冲。在第二回合时敌方增援会登场，那是女天顶星人军，她们会和男天顶星人军交战。而且按照原作的情节，让麦克斯与米莉娅交手的话，会引发剧情并提升熟练度。