以下是3DS《口袋妖怪ORAS》的二周目流程剧情攻略，在本次口袋妖怪红宝石蓝宝石复刻版二周目中有很多一周目没有的内容等待着玩家们去开发寻找，更强力的对手，更强的神奇宝贝，还有各种隐藏事件。
　　一、序幕

　　通关后打开游戏

　　和往常不同，画面出现在绿岭市宇宙中心

　　警报响起，流星群轨道突然改变了方向，要撞上我们的星球

　　将撞击在琉璃市西南部131号水道上的一个小岛

　　画面转到另一个地方（天空之柱），Zinnia脱掉了火岩队队服

　　她说

　　剩下的时间只剩几天了

　　因为那个孩子阻止了一只超古代PM复活成原有的样子，所以事态变得不太好

　　但我有一个新计划

　　如果我调整一下由大量Key石组成“那个东西”…………（那个东西指的应该是让裂空坐Mega进化的石头）

　　然后望向天空，“我发誓我会保护你的”

　　章节正式开始

　　二、与Zinnia的初次见面

　　画面回到主角家里，下楼看到父母

　　爸爸说主角变强壮了，赠送给了主角两张票

　　这两张是绿岭市宇宙中心的星空展的入场券，爸爸没办法陪妈妈去了所以让主角邀请CP一起去，之后便离开回道馆去了

　　这时候电视上开始演有关星空秀的节目，结束后妈妈怀念了一下11年前和爸爸一起去的时候

　　一出门就看到Zinnia在门外，她自我介绍了之后说这里是个好地方之类比较奇怪的话后就离开了

　　进CP的家，CP说有个奇怪的女人从她房间窗户进入她房间，拿走了她的Key石，CP的队伍打不过她，然后她听到那个女人在走之前口中碎碎念“下一站橙华市”，让主角小心

　　去研究所找博士，博士将主角的图鉴升级为了全国图鉴

　　前往橙华市吧

　　三、橙华市的纷争

　　在小光的家门口看到篝火想要抢走小光的Key石

　　上前阻止，触发战斗

　　火岩队干事篝火

　　喷火驼lv53

　　胜利后她说“流星瀑布，老大的Key石”之类的话就走了，小光说他的Key石也消失不见了，让主角小心

　　接着领航员收到了大吾的通讯，说他需要主角前往卡那兹市的得文公司，他有些话要亲自和主角说

　　那么前往卡那兹市吧

　　四、社长的委托

　　来到得文公司门前，上前和大吾对话，说有坏消息，然后将主角带进公司找社长

　　社长说有很沉重的话题，问主角是否要听（当然要）

　　接着社长开始说故事（BGM是AZ的变奏版，好好听！）

　　（其实就是AZ的故事）

　　3000年前，在离这里很远的地方有一场大战

　　那场大战因为一个人制造的武器而终结

　　而究竟是什么样的能源能够给这死亡武器以能量？你知道吗？

　　你看，它是建立在PM的生命上的

　　从那么多PM的牺牲中获得的能量，必然会受人们谴责

　　但我的祖父，前任得文公司社长说过

　　“难道我们就不能利用这能量去改善人类的PM的生活吗？”

　　所以他创造了得文公司最伟大的发明：无尽能源（InfinityEnergy）

　　正因为无尽能源，得文公司才成为了丰缘地区最强的公司之一

　　你曾经帮我们夺回的包裹就是利用无尽能源让潜水艇发动的马达

　　不久后我们将会努力尝试更多人类的发展

　　接下来我们将开始探索宇宙

　　绿岭市宇宙中心的火箭就是用我们的无尽能源，这是我们梦想、情感和技术的结晶

　　但我们从没想过它们会成为拯救世界最大的希望

　　我的前言就到这么多，接下来是正事

　　现在有一个巨大的灾难在接近我们

　　一块直径超过6英里，巨大的小行星正在即将撞击我们星球的轨道上

　　我们正和绿岭市宇宙中心合作，首先要意识到这个危机

　　我们正在计划对策，用我们的火箭，但是为了让这个计划实现，我们需要一块陨石碎片

　　大吾打断说所以社长就是要主角去寻找碎片？

　　社长说希望主角去武斗镇附近的石之洞窟，去寻找陨石碎片，然后让大吾去宇宙中心做准备，用他给的LinkCable

　　那么前往武斗镇吧

　　五、石之洞窟寻找陨石碎片

　　在石之洞窟可以捡到TM65阴影爪和大钢蛇Mega石

　　在石之洞窟那个有壁画的房间，看到Zinnia在看着壁画

　　“这个表示原始进化，那个表示Mega进化，我们的祖先也曾住在这里，我的祖先曾告诉我如何保护世界，只要被预言就可以避免来自宇宙的威胁，从一个比天堂还高的地方”

　　然后发现主角，触发战斗

　　Zinnia

　　怪颚龙（gen6霸王龙）lv55

　　七夕青鸟lv55

　　暴蝾螈lv57

　　胜利后她将陨石碎片交给了主角，主角背包里的陨石再次发出光芒并发生变化，离开前她问主角现在在做的事是不是符合主角坚持的理想，还是基于现实

　　接着收到大吾的通信，说如果找到了陨石碎片就赶快赶到绿岭市宇宙中心，时间不够了

　　那么前往绿岭市吧

　　六、流星瀑布寻找陨石碎片

　　到达绿岭市宇宙中心，上楼看到大吾和索南斯博士（研究陨石），将陨石碎片交给他们后开始实行计划（说了一堆技术性的话）

　　他们说还需要一块陨石碎片，这时候Zinnia出现了，她说这样利用能量会重蹈3000年前的覆辙

　　她问主角是否有更好的主意，我选了有（……

　　然后她说不好意思打扰对话后离开了

　　博士继续说，另一块陨石碎片在流星瀑布，大吾先行去了，跟上吧

　　来到流星瀑布深处看到了大吾和一个龙的传人说话，那个人开始叙述他们的传说。

　　（再次AZ的变奏曲）

　　“很久以前，丰缘地区一直处在灾难之中

　　有的时候，毁灭来自于从遥远的宇宙降临的巨大的流星群

　　有的时候，原始形态的超古代PM也把我们带到毁灭的边缘

　　每一次，伟大的裂空坐都会将我们从末日中救出解救

　　被选上的传说掌门人（lorekeeper），在一块发出彩虹色光芒的石头前，表达了强烈的祈愿

　　然后伟大的裂空坐全身充满闪耀的光芒，变换了形态

　　变换形态后，裂空坐的力量比以前更强大，甚至战胜了超古代PM的原始形态的力量”

　　大吾似乎想到了什么，认为这和Mega进化的步骤很相像

　　“是的，后来人们称之为Mega进化”

　　大吾询问了关于传说掌门人的事，

　　“是继承了在世界遭受灾难时召唤伟大的裂空坐的知识和能力的人，现任的掌门人叫做Zinnia

　　现在的灾难曾经发生过两次，Zinnia曾尝试过用自己的方式避免

　　为了召唤裂空坐，她加入了一个企图复活超古代PM的组织，现在她正在环游大陆，搜集Key石”

　　然后她说Zinnia会按照自己的方式拯救星球，因为牺牲是无法避免的

　　对话结束，大吾回了卡那兹市，跟上去吧

　　*流星瀑布深处可以捡到化石翼龙Mega石

　　七、得文公司的三连战

　　回到卡那兹市，刚想进得文公司，却听到惨叫，曾经帮助过的研究员跑出来撞了个正着，后面有个火岩队队员追了上来，触发战斗

　　火岩队队员1号

　　大狼犬lv48

　　大嘴蝠lv48

　　胜利后他离开了，这时候又有一个火岩队队员从公司里追出来，触发战斗

　　火岩队队员2号

　　双弹瓦斯lv51

　　胜利后他也离开了，这时候第三个火岩队队员从公司里出来，触发战斗

　　火岩队队员3号

　　大嘴蝠lv49

　　喷火驼lv49

　　胜利后他也离开了，这时候研究员说遇上大麻烦了，火岩队偷走了他们正在开发的LinkCable的控制装置——空间移动装置（DimensionalShifter）

　　偷走它的人长得比较矮，很可爱，但眼神很险恶，他说他们应该去了绿岭市宇宙中心

　　那么回绿岭市吧

　　八、

　　回到绿岭市，去宇宙中心的路上看到篝火带着火岩队队员们往宇宙中心去了

　　赶到宇宙中心，触发火岩队队员5打1

　　5个火岩队队员

　　5只大狼犬lv25（5次威吓）

　　胜利后他们说篝火感觉很悲伤希望主角帮帮她

　　上楼，看到大吾在和篝火对峙，篝火想要毁掉这个世界，和大吾配合触发双打对战

　　火岩队干事篝火火岩队队员

　　Mega喷火驼lv55大狼犬lv51

　　双弹瓦斯lv51

　　胜利后，Zinnia的咕妞妞出现把篝火手上的空间移动装置夺走，她说这火箭也许能拯救我们世界，但也会带给其他世界灾难

　　她说一个地区的人要如何在没有任何技术破坏陨石或者能量使其改道？

　　然后她将空间移动装置破坏掉了

　　接着Zinnia将篝火手上的Key石也抢了过来后离开了

　　他们说Zinnia可能会去火岩队的秘密基地

　　那么向水静市出发

　　九、取得进入天空之柱的资格

　　到达火岩队基地，按照之前找潜水艇的路线再走一遍，路上还会碰到几个小兵

　　在先前有潜水艇的地方被火岩队队员告知首领的房间不在这（原来是要去赤焰松的房间噗）

　　那么去找之前拿到大师球的房间吧

　　在首领的房间看到Zinnia和赤焰松的对战刚结束，Zinnia获胜了，然后夺走了赤焰松的Key石

　　她说终于可以召唤裂空坐了，让主角到天空之柱去后离开了

　　赤焰松赠送给了主角喷火驼Mega石

　　这时候大吾发来通讯，让主角马上和他会合，在宇宙中心2F

　　那么回到绿岭市吧

　　回到宇宙中心2F，主角将在基地里看到的和大吾说了，大吾说米可利知道怎么打开天空之柱的封印，让主角去觉醒寺找米可利

　　来到觉醒寺入口，看到米可利和看守觉醒寺的老人在对话

　　米可利说他们收到了一样从卡洛斯地方来的巨人给的东西，然后说他先行去天空之柱，让主角准备好后就过去

　　来到暮水镇（キナギタウンPacifidlogTown）

　　PC左边可以捡到袋龙Mega石

　　来到天空之柱，米可利在门口等候，他说他已经解开了封印

　　然后他说他需要验证主角的实力，触发战斗

　　琉璃市的米可利

　　携带精灵6

　　吼鲸王LV55特性：顿感技能：喷水+重量炸弹+地震+暴风雪

　　毒刺水母LV55特性：净体技能：淤泥波+潮水+祈雨+闪耀光芒

　　乐天河童LV55特性：轻快技能：下马威+沸水+能量球+急冻光线

　　鲶鱼王LV55特性：顿感技能：地震+浊流+岩石封+祈雨

　　暴鲤龙LV55特性：威吓技能：登瀑+咬碎+冰之牙+石刃

　　美纳斯LV57特性：神秘鳞片技能：龙之波动+暴风雪+自我再生+水压

　　说完他祝福了主角后离开了

　　十、天空之柱，Zinnia与裂空坐

　　进入天空之柱，看到Zinnia站在中间

　　上前对话，她说墙上的壁画画的就是人类、PM和自然的历史，流传了几千年，开始叙述她继承的传说（一层一章节）

　　第一章

　　“几千年前，在原始时代，世界充满着过剩的自然能源

　　原始固拉多和原始盖欧卡为争夺这能源无止境地激烈冲突

　　面对两只PM强大的力量人们什么都做不了

　　唯一的选择就是看着灾难接连不断地袭击他们

　　有一次，巨大的流星群从宇宙的黑暗中袭来，从一个比天堂更高的地方

　　而大多数流星都落在了一个龙使者部落长期居住的瀑布”

　　第二章

　　“落下的流行闪烁着彩虹般的光辉，好像有巨大的生命在里面

　　似乎是被这光芒所吸引，一只闪耀着强烈的绿宝石色彩的PM从天堂降临

　　它就是裂空坐

　　裂空坐的力量压过了两只原始PM，世界重新恢复了和平

　　丰缘地区的人们将尊裂空坐为真正的救世主

　　1000年后，流星群再次袭来

　　巨大的流星群，比以往任何一次都大，袭击了这个星球，并深深地潜入海底并留下了比其他都大的火山口

　　也就是现在的琉璃市”

　　第三章

　　“陨石的袭击是对人类灾害的首位

　　当其袭击这个星球的时候，土地裂开，从裂缝中涌出了在丰缘地底下的自然能源

　　由于对这能源感到饥渴，原始固拉多和原始盖欧卡再次苏醒

　　人们希望被绿宝石光辉包覆的传说中的PM能再度出现

　　在琉璃市中心的巨大陨石发出漫天的光芒

　　从其光芒中，它像一块巨大且能量强大的Key石

　　再一次，裂空坐从天堂某处降临

　　人们在裂空坐面前跪下并请求拯救

　　这时，传说中的PM发生了巨大的变化

　　它被炫目的光芒包围，当光芒褪去后，人们见到了从未有过记载的裂空坐——庄严的样子，闪耀者炽热的生命力”

　　第四章

　　“裂空坐再次面对原始固拉多和原始盖欧卡

　　从它身体飘起的金色纤维覆盖了天空

　　绿宝石的光辉照亮了整个区域，挂起了可怕的风

　　风和绿宝石的光辉明显使两只原始PM的力量衰弱了

　　原始之力被吸收后，两只PM消失在地底和海底深处

　　裂空坐看着它们离开后变回原来的样子

　　然后高飞回它居住的天堂

　　一个来自遥远大地的见证这一事件的很高的拜访者说，

　　{这是Δ（Delta），从这个世界巨大的骚乱中诞生，通过人类的祈愿和石头的力量之间的联结，可以平息折磨这个世界的动乱}

　　当龙使者为保存这赋予裂空坐力量的彩虹般的石头也为了能和裂空坐更近一些建造巨大的塔时，为了记录这段历史，他们在这留下了壁画”

　　第五章（最终章）

　　“接下来的1000年世界和平

　　但龙使者从历史循环的本质，预测流星群将会再次来临

　　他们预言即将来临的流星群会比以往更大

　　可能会大到能够将整个世界永远摧毁

　　为了防止这巨大的灾难，那些有历史知识的人们拟出了个计划

　　唤醒裂空坐，伟大的救世主，在流星群到来前召唤它来到陆地上”

　　天空之柱里可以捡到TM64大爆炸

　　故事结束了，也到达了天空之柱的顶端

　　看到Zinnia在圣坛上，准备召唤裂空坐来破坏即将来临的流星群

　　（Zinnia说出了心里话，BGM超级好听）

　　“当我只是一个小女孩的时候，我总是喜欢仰望着天空

　　在我心里充满不确定，感觉自己的心就要被击垮的时候

　　在我极度悲伤和孤独，感觉心灵承受不了的时候

　　我抬头往上看，让我的眼泪永不会流下”

　　“我曾经一直喜欢这样看着星星

　　和Aster一起

　　我们一直都在一起，不管开心还是难过

　　我爱她，我想用我的所有来爱她

　　但我还是失去了她（她叫她的咕妞妞Aster，但咕妞妞明明一直在她身边，所以可能她失去了是其他的人或PM然后把咕妞妞命名为了Aster来治愈伤痛）

　　……

　　哈哈哈

　　……

　　我想见到她

　　我想再度和她在一起

　　我亲爱的Aster”

　　说完后她开始召唤裂空坐

　　说了一段话后，她身上的Key石发出炫目的光芒

　　裂空坐降临

　　Zinnia希望裂空坐Mega进化，但是Key石并没有产生反应

　　她说难道是裂空坐能量不足？本应该躺在裂空坐身体里的陨石不足？是这几千年时间把能量消耗了吗？

　　她绝望地跪了下来，这时候，主角包里的陨石开始发热，且不断加强，Zinnia说者陨石看起来像Mega石

　　裂空坐吞下了主角的陨石，裂空坐的身体开始发光

　　陨石使裂空坐有了足够的能量Mega进化

　　Zinnia让主角收服裂空坐，然后用它拯救丰缘地区

　　如果打败的话就要重新再来，直到收服为止，裂空坐捕获率很高（目测45左右）

　　此处可以保存，上前对话触发战斗

　　裂空坐lv70龙舞+神速+龙之波动+飞天

　　最终话、战胜代欧奇希斯，和Zinnia的告别

　　收服后Zinnia将族群流传的最后一样秘籍，裂空坐的“画龙点睛”，传授给了主角的裂空坐

　　接着她要主角展示控制裂空坐的能力，触发战斗

　　（裂空坐必定首发，且可以Mega进化，技能为神速+龙之波动+龙舞+画龙点睛）

　　Zinnia

　　黏黏龙lv60特性：食草技能：龙之波动+浊流+十万伏特+冷冻光线

　　音波飞龙lv60特性：穿透技能：龙之波动+空气切割+阴影球+愤怒门牙

　　七夕青鸟lv60特性：自然回复技能：龙之波动+月之爆破+火焰放射+高级噪音

　　怪颚龙lv60特性：坚硬下颚技能：龙之爪+咬碎+地震+石刃

　　Mega暴蝾螈lv62特性：威吓→飞行皮肤技能：龙之爪+咬碎+火之牙+雷之牙

　　胜利后Zinnia说主角一定和裂空坐一起可以打败那群逼近这个星球的流星群

　　主角换上了火岩队套装乘着Mega裂空坐穿过了大气层（BGM再赞一个！）

　　裂空坐使用了画龙点睛将陨石打破

　　陨石中间出现了一个三角形，然后从里面衍生出了代欧奇希斯，触发战斗

　　（首发必定是Mega裂空坐）

　　代欧奇希斯（普通形态）lv80宇宙力量+自我再生+精神增压+破坏光线

　　打倒或收服后主角回到了天空之柱，却发现Zinnia不在了，Aster（咕妞妞）递来一封Zinnia的信（BGM太赞……）

　　“我终于能够让所有事情结束了

　　感谢你

　　我想我现在会花些时间尝试去寻找是否有任何新开始的可能

　　为了曾经失去过的东西

　　直到我们下次的相遇

　　Zinnia”

　　流星群消失了，危机解除了

　　画面跳转小光的家

　　小光即将出门的时候，父母叫住了他，表示了担心，小光说一切都没事了，主角将Key石换给了他，千里给了小光一张去战斗区域的票，便离开家了

　　小光的父母为小光越来越健康活泼感到十分幸福和感动

　　画面跳转火岩队基地

　　无言的三个人，火村打破了沉寂，命令篝火向赤焰松道歉

　　赤焰松表示接受篝火的道歉，同时也向篝火道歉

　　他从没想过篝火会对他如此忠诚

　　他打算重新开始新的道路

　　画面跳转冠军殿堂

　　大吾和米可利在对话

　　大吾向米可利在天空之柱的帮忙表示感谢，并说这次事件也使他想了很多也明白了还有很多他不知道的事，如果主角没有出现，他一个人是不可能阻止这一系列事件的

　　并表示自己在时机成熟的时候，会离开精灵联盟去探索世界，并让位给米可利

　　画面跳转流星瀑布

　　Zinnia对着瀑布发呆，说一切都结束了

　　这时候，奶奶走了过来，说她已经做得很好了，并说所有事情只有在有新开始的时候才会结束，是时候好好休息了，朝着新的生活迈进

　　然后一个人离开了

　　画面跳转主角的家

　　CP的父母也都在（这是亲家相见的节奏吗！）

　　主角和CP此时应该正在享受星空展

　　画面跳转绿岭市宇宙中心

　　主角和CP的约会（喂

　　闭馆时间到，主角和CP回到未白镇后告别，回家

　　本章节，完