离开榆次，一行人通过景阳直奔晋阳，在城门口岩洪回想起父母被秦军杀死的情形，更加深了大家对暴秦的仇恨。同以往的城镇不同，晋阳可是个大地方，而且正好赶上赶集的日子，很是热闹。程豫说自己的家在酒楼附近，沿路寻到城北，终于找程豫家，却发现家里根本没人，同附近的居民对话才知道程豫有急事刚出了门。找不到程豫，在晋阳呆着没有什么意义，一行人从东门准备离开晋阳城前往九原城。在城门口盖聂被人认出，原来是盖聂的好友张良。张良听说盖聂要帮助荆轲去刺杀秦王，就劝说盖聂不要去冒这个险。说起蓝薇找补天石的事情，张良说自己的老师姬晨处也有一块补天石，并邀请蓝薇等人一起前往云中村拜访自己的老师姬晨。众人约定明早在城门口会合一同前往。
众人回到客栈，岩洪责怪蓝薇不应轻信张良，应该有所防备，彩欣看不过帮助蓝薇说话，围绕“秦国人”的问题岩洪和彩欣发生了争吵，彩欣哭着跑了出去。蓝薇同梁虎，盖聂一起出门寻找彩欣，让岩洪留在客栈中反省。出门问更夫，得知彩欣跑向了城门方向，在城门口碰到了看门老人，说彩欣去了农田方向。众人追到麦田劝说彩欣，这时岩洪也现出向彩欣道歉，矛盾终于解决。众人见天也快亮了，就不再回客栈而是围坐在麦田聊天，盖聂回忆起小时候的事情，说自己的双亲都为匈奴人所杀，师傅搭救了自己并传授一身的武艺，还把女儿许配给自己，可自己最终也没能保护好妻子……天亮后，众人到城门口和张良会合，一起前往云中村。
支线1：在城中酒馆等处，会听到城西彭家庄彭无敌的儿子得了怪病，正找医生医治。来到城西彭家庄见到彭无敌及其结义兄弟易飞，蓝薇答应替彭无敌治好他儿子的病。到彭公子的卧房，发现彭公子并不是生病而是中毒，症状和自己在榆次虎蛟洞中中毒的情况差不多。蓝薇想起当初那个卖假药的骗子曾经供出过疗毒药方，是虎蛟肉加上枸杞、雪莲等物。告诉彭无敌药方后，彭无敌要蓝薇等人去找虎蛟肉，其它的交给易飞去办。出彭家庄庄口西南角就有一个虎蛟洞，进洞去杀虎蛟就可以了，不过要注意治病用的虎蛟肉和作为补血用品的虎蛟肉不同，它不能服用，只有杀死洞穴最深处的一只虎蛟才会得到。得到虎蛟肉后回去见彭无敌，彭无敌叫蓝薇去厨房配药，与易飞对话后去西院厨房，配好药后果然是药到病除。来到彭无敌居室，蓝薇又对彭无敌说彭公子中毒并非偶然而是有人帮意陷害，彭无敌要蓝薇帮忙调查此事，还说易飞可以协助调查。到易飞房中向易飞了解情况，并没有发现什么异常(此处要多对话几次，直到对话中出现易飞说“最近无人来过”时)，再向厨师了解情况，得知彭家曾请了两个工匠制作屏风，而这两个工匠又同厨师一起喝过酒，并把厨师灌醉。调查彭无敌屋中的屏风可发现工匠下毒的证据，蓝薇马上又找易飞询问有关工匠的事情，易飞支支吾吾看来别有隐情，但还是告诉蓝薇工匠住在西院客房里(共有2处)，到客房中和工匠发生战斗，杀死一个工匠，而由易飞负责的那个工匠却逃跑了，向彭无敌说明此事后，蓝薇等人又回到晋阳。一到晋阳便被一青年堵住去路，交手之后得彭无敌是个恶霸而易飞是帮凶。到易飞家中向易飞的父亲和妻子了解情况。才发现自己帮错了人，于是决定杀死彭无敌和易飞为民除害，返回彭家庄，在庄正遇害易飞，蓝薇斥责易飞不应助纣为虐，易飞却要蓝薇不要插手此事，看来易飞还有别的图谋，双方动起手来，此时如战胜易飞，可以直接冲入庄内大厅杀彭无敌，如果输给易飞也不要紧，易飞会嘲笑蓝薇后返回彭家庄，这时蓝薇进入彭家庄大厅，会发生易飞刺杀彭无敌一幕，原来易飞忍辱负重接近彭无敌就是要为民除害。

支线2：在晋阳城西的集市下方，会碰到卫绅和天眉二人，卫绅为了治好天眉的病费尽心思，听说晋阳有千年人参能治病，他们就来到晋阳，不料千年人参被城西彭无敌买走，不肯卖给他，蓝薇听后很是同情他们，决定帮忙弄到千年人参。进入彭家庄，在完成第一个支线时有去厨房配药的情节，厨房里有个箱子，千年人参就放在里边，返回后送给二人，正所谓“为救人命取之无伤大雅”。集市中的铁匠处还可以学习一些打造技能。

支线3：在城中遇到一人在卖宝剑，盖聂十分感兴趣，便与之攀谈，那人请蓝薇等人去客栈交易。到客栈二楼见到卖剑之人，却因他开价过高无法成交，只好离去，到了客栈一楼和老板交谈，老板说还有一个人也上楼买剑了，可蓝薇并没有看见这个人，觉得事情很蹊跷，就返回二楼查看，发现卖剑人已被除打伤，剑也被抢了，又是怪盗寒星干的好事，一路追赶到城北的树林，终于找到了寒星，蓝薇等人虽打败了寒星，但还是让他逃掉了。
蓝薇一行和张良经过云中岭到达云中村。见到了张良的老师姬晨，在姬晨家的地下密室里，蓝薇又得到了一块补天石。姬晨还向众人提到，当年蚩尤企图奴役人类，因此与黄帝展开了百年的战争，蚩尤因为失去人类支持而被黄帝打败。当得知盖聂要去刺杀秦王时，姬晨劝他不要前往，说如果刺杀成功肯定是公子扶苏继位。此人待人宽厚，又精明的很，秦国只会更强大；若失败，赢政一怒之下必然加快吞并其他国家的速度，姬晨劝众人三思。离开云中村继续前行就到了天湖村，天湖村有得昆吾剑的任务，关系到最后能不能打出美满结局，请大家一定要注意。

支线4：在云中村的河边，会遇到采草药的莫纤，蓝薇答应帮她寻找灵珠草，草就在河对岸，然后到村里的白善家，得知白善为了救治村民，还需要三棵灵珠草，到小河南岸可分别找到。再和莫纤交谈，得知是河水被污染才导致辞村民集体中毒，蓝薇等人就到河的源头查看究竟，在河的源头推开石头发现一个山洞，里面有只毒心兽，原来村民中毒都是它的原因，杀死毒心兽可得毒兽的心脏--万毒之心。与莫纤对话后回去见白善，却得知白善为配解药以身试毒，自己也中了毒，得知他已经把解药配好了，蓝薇答应帮白善送解药。一共得到四份解药，莫纤房里的病人每人一份就可解毒，另一民居的病人需要二份解药。送完解药后回去复命，原来白善是名将白起之后，为赎先辈杀伐过多之罪才拼命治病救人。如果此前在红泥村泥沙谷碰到姜拓并与之对话，此时去进村口处可以找到姜拓，就可用毒兽心脏配得解药，与莫纤对话后救治白善。

支线5：来到天湖村，应先去村中最北端的树林里，此处会遇到一个因与邻家小孩打斗而离家出走的迷路小孩，返回村中民居内，与居民对话，得知他们的孩子小石头离家出走，众人想起林中的小孩，便把小石头带回家中。

支线6：天色已晚，与村民赵老汉对话后可在其家中留宿一晚，这时有一伙强盗跑到村里，强迫村民们搬家，众人出手打败强盗，强盗头子凌彦说只有自己才能阴止天湖干涸，拯救全村。在天湖畔，从凌彦口中得知天湖剑冢和守护神兽的事情，原来天湖底封印着黄帝战胜蚩尤所用的昆吾剑，原本有冰，火两个神兽一起守护，不知何人杀死了冰神兽，现在只剩下火神兽，湖水自然要干涸了，只有杀了火神兽才能解决湖水干涸的问题。于是众人来到天湖，下到地下迷宫，找到并杀死火神兽，得到火玉和火鳞片，回去和凌彦对话，他竟要动粗夺取火玉，原来杀死冰神兽的也是他，再次打败他，可得到冰晶，重新下到天湖底，在剑冢中使用冰晶，火玉打开开关，得到昆吾剑(冰晶放在左侧，火玉放在右侧)。

支线7：在天湖村村口又遇到卫绅和天眉，千年人参并没有彻底治好天眉的病，他们又来到村中寻找回天草，完成杀死火神兽的任务后可以得到鳞片，找村中李三可换回天草，交给卫绅救人(如果不完成杀死火神兽的任务，也可以直接用2000文钱购买回天草)

支线8：打败强盗头子凌彦后，他说自己是来寻找妹妹凌秀的，会拿出信物长命锁给蓝薇看，同营地里的强盗及村中居民对话，可推测出凌彦的妹妹就是赵老汉的养女赵凌，到真老汉家中，可撮合凌彦、凌秀兄妹团圆。
蓝薇一行人离开天湖村。经过云中村到达云中岭，意外碰到了倒地受伤的程豫，盖聂提议将其救回晋阳其家中，岩洪认为程豫不守信用不用理睬，但蓝薇赞同盖聂的意见。
在晋阳程豫家中，蓝薇等人找到一些竹简，但竹简上很多字都被刮了下去，只看出“刑天”之类的字样，完全不能理解，蓝薇等为程豫请来郎中，郎中说程豫没有伤到要害，吃了他的药明天早上就可醒来，蓝薇决定去客栈投宿，明早再来找程豫。
出了程豫家又碰到殷成，他说晋阳已经全城宵禁了，要蓝薇不要乱跑，蓝薇提到送程豫回家一事，殷成好像很吃惊的样子。到了客栈，蓝薇向老板打听为什么城里宵禁，老板说因为有个叫荆轲的人刺杀秦王，所以城里才宵禁，在得知荆轲刺秦没有成功后，盖聂十分痛心和惋惜。夜半，盖聂独自饮酒，看来荆轲的死对他打击很大，彩欣出现劝说盖聂要振作起来，正当彩欣还要有别的表示时，冒失的蓝薇跑了过来，要盖聂和她一路去寻找补天石，盖聂考虑以后就答应了。与此同时，程豫家中出现了一条毒蛇，它慢慢爬向了程豫的床……
第二天早上，蓝薇等到程豫家发现程豫已经中毒而死，大夫说咬死程豫的毒蛇在晋阳城非常罕见，但事已至此也没有办法，只好离开晋阳继续前行。经过云中岭到达吉阳村。一到吉阳村就发现秦军在驱赶老百姓，众人以为秦军在抓苦役，就冲上去大战一场。打胜后才发觉是一场误会，原来这支秦军是秦王公子扶苏的部队。由桓峰将军率领，在此剿匪怕误伤到百九，想把百姓迁到九原城中，一些壮年百姓想留下来帮助官兵杀强盗，这才起了一些争执。误会解除后，桓峰离去，彩欣却由桓峰的名字想起了自己的父亲桓琪……

支线9：在村中间的屋子里找到顶替桓峰留下来的秦将，谁知这家伙是文官出身，根本不会打仗，蓝薇只好主动请缨前往消灭山贼大王吴海回去交差即可。