【尼西罗机构】
·从银座出来之后往南走，从正面进入尼西罗机构
 
·B2F
 
中枢部分：与圣交谈，选项“是的——缘/不是——寂、结”
 
从过不去的通道那里乘电梯来到B10F
 
·B10F
 
终端/台座
 
在中央圆形大堂与梦魔和木叶天狗强制交战
 
战斗：vs.夜魔梦魔（魔力·精神无效/冲击弱点）
 
战斗：vs.妖魔木叶天狗（冲击·精神无效/魔力弱点）
 
战斗后获得黄色道具
 
解决祸津日储藏库的旋转谜题
 
中间开关蓝色→西北开关蓝色，接着继续前进
 
在白色宝物库中与埃力格交战
 
战斗：vs.堕天使埃力格（物理·破魔抗性/咒杀无效/电击弱点）：召唤妖魔狄丝
 
对策：姆多/佩特拉眼对策狄丝的提特拉加
 
与埃力格交战后，从宝箱中获得白色道具
 
返回祸津日储藏库，从东南方的梯子前往B11F
 
·B11F
 
S终端
 
西南开关蓝色→东边开关蓝色→西北开关蓝色，接着继续前进
 
在通道中与堕天使埃力格交战（共计3处）
 
在红色宝物库最深处的包厢中获得红色道具，并与贝里斯交战
 
战斗：vs堕天使贝里斯（火焰吸收/破魔·咒杀·状态异常无效/物理抗性/冰结弱点）：召唤夜魔魅魔
 
返回祸津日储藏库，将西北的开关设为红色，从东北的梯子前往B12F
 
·B12F-B13F
 
在祸津日储藏库受到迦温的阻碍，恢复开关并继续前进
 
前进→东北开关红色→恢复蓝色
 
向南前进→中央开关红色→从南边中央的梯子下到B13F，爬上通道中的梯子，将中央的开关恢复蓝色
 
从南边中央向西前进→西北开关红色→东北开关红色→西北开关蓝色→东北开关蓝色，急着继续前进
 
打开绿色宝物库最深处的宝箱，离开房间时会出现迦温
 
开启8门
 
从S终端开始看，打开左数第3扇门后，与迦温×3交战
 
战斗：vs.夜魔迦温×3（4属性魔法·咒杀无效/状态异常抗性/破魔弱点）
 
对策：用姆多的妖魔狄丝的提特拉加、破魔系魔法
 
战斗后获得绿色道具
 
尽头房间的6个地方会强制发生战斗（↑的迦温×3战前）
 
战斗：vs.妖精凯尔派
 
战斗：vs.妖精凯尔派×2
 
战斗：vs.夜魔迦温
 
·回到B10F，将黄白红绿四个道具壮哉台座上，从螺旋状的通道前往B14F
 
·B14F：乘电梯下到B15F
 
·B15F
 
S终端
 
在中枢与冰川交谈，之后与欧赛交战
 
战斗：vs.堕天使欧赛（破魔·咒杀无效/状态异常抗性）
 
对策：卡加/恩达系技能、物理减半姆多、带物理抗性的仲魔、全体恢复等，注意提特拉康和马卡拉康
 
打倒欧赛后，获得祸魂“诅咒”
 
·战斗结束后有梦魇系统的剧情，接着被强制传送到外面的银座2D地图。之后就再也无法进入尼西罗机构了，注意别忘记收集道具
 
·提示
 
可以考虑拥有提特拉加的妖魔狄丝合体，培养变异的军神瓦尔基里
 
电击弱点的敌人较多，主角可以学习一下放电（21），拥有电击魔法的仲魔会对战斗更为有利
 
【池袋】
·曼茶罗军大本营
 
1F：与橘千晶交谈，选项“明白——缘/不明白——寂/无法确定——结”
 
B1F：与新田勇交谈
 
回收B1F/3F牢房内的宝箱
 
64F：与牛头天王交谈，离开房间后与托尔交谈
 
大本营1F的大门可通行，可前往池袋地区
 
【池袋-歌舞伎町区域】
·前往歌舞伎町看守所的途中，在高速公路上出现魔人地狱天使，战斗前可以在选项中选择“逃跑”来避免交战
 
战斗：vs.魔人地狱天使（冲击吸收/火焰·破魔·咒杀·状态异常无效）
 
对策：火焰·冲击无效的仲魔、卡加/恩达系和全体恢复魔法，这里卡加/恩达系用来对技能做无效化的辅助，以物理攻击的暴击为主
 
·打倒魔人地狱天使之后获得“威严的烛台”
 
·离开高速公路后，从2D地图下方前往歌舞伎町看守所
 
【阿玛拉深界】
·阿玛拉深界第2劫
 
攻略时期：获得“威严的烛台”/“永远的烛台”后
 
将两个烛台放在台座上，开启第2劫1F台座之间·内部的门后即可攻略
 
烛台：“威严的烛台”/“永远的烛台”
 
剧情：诅咒回廊——讨伐别西卜之前
 
攻略限界：第3劫1F台座前，到发生四骑士剧情为止
 
·提示
 
地力不足的话就先练级
 
在B2F黑暗掮客处可以花3万魔货购买猫又，必买
 
离开B2F的诅咒通道后，可以在B3F的伊夫里特处获得25万魔货
 
【歌舞伎町看守所】
·使用1F、2F、4F的奇妙装置可以往返于海市蜃楼的里外进行攻略
 
海市蜃楼中：会遇到似人和龙王蛟，上下颠倒
 
海市蜃楼外：操作开关，使用终端
 
NS版《真女神转生3》——流程攻略02
 
战斗：vs.龙王蛟（电击吸收/冰结·破魔·咒杀无效/火焰弱点）
 
对策：冰结无效·精神无效仲魔、火焰属性攻击
 
·打倒蛟后获得祸魂“瘴气”
 
·在最终房间遇到太洱
 
发生剧情
 
·与旁边房间的勇交谈，选项“反驳——缘/道歉/离开房间——结”
 
·提示
 
出现的恶魔火焰弱点较多，推荐使用火焰系技能在这里练级
 
【银座】
·在终端与圣交谈后，从曼茶罗军大本营1F的大门离开后，前往东池袋站
 
【池袋坑道-浅草】
·从东池袋站进入坑道（B1F）
 
坑道内部黑暗地带/伤害地带的对策请见最下方的提示
 
·B2F
 
北侧：魔法之箱：脉轮壶
 
南侧：终端，下梯子来到B3F
 
·B3F
 
西侧的房间下梯子来到B4F
 
·B4F
 
S终端/黑暗地带/落下陷阱前往B5F
 
西侧的岩屋与金鬼交谈，根据选项的不同发生战斗，可以避开战斗
 
战斗：vs.妖鬼金鬼（物理抗性/破魔·咒杀·状态异常无效/4属性魔法攻击弱点）
 
对策：物理减半的卡姆德或盖亚/带有无理无效的仲魔、4属性魔法+玛卡卡加、其他卡加系等
 
北侧房间前往B3F
 
·B3F
 
北侧房间上梯子来到B2F（浅草路线）
 
从西北房间被伤害地带围绕的陷阱中前往B4F，水鬼路线，通道中魔法之箱：速度之香
 
·B4F
 
西侧岩屋中与水鬼交谈，根据选项的不同发生战斗，可以避开战斗
 
战斗：vs.妖鬼水鬼（物理·电击·冲击抗性/冰结吸收/破魔·咒杀·状态异常无效/火焰弱点）
 
对策：冰结无效瘴气、带有冰结无效的仲魔、火焰系攻击技能
 
·B2F
 
S终端/岩屋，S终端左侧：隐形鬼，藏前站站台西侧：风鬼
 
从西侧离开藏前站站台，最里面的岩屋与风鬼交谈，根据选项的不同发生战斗，可以避开战斗，但会没收100魔货
 
战斗：vs.妖鬼风鬼（物理抗性/冲击吸收/破魔·咒杀·状态异常无效/电击弱点）
 
对策：冲击无效一二三、带有冲击无效的仲魔、电击系攻击技能
 
打倒金鬼、水鬼和风鬼后，进入S终端左侧的岩屋，进入后强制与隐形鬼交战
 
战斗：vs.妖鬼隐形鬼（破魔·咒杀·状态异常无效）
 
对策：FULL时进入岩屋发生战斗，敌人会分身，只有攻击带影子的本体才能打倒敌人。没有分身的时候，有很大概率会眼光→使用塔尔·拉库·斯库卡加再分身。偶尔会使用玛哈姆多和暗剑杀。需要注意的是，全体攻击可能会让对方把握下一回合
 
战斗后，从最终房间的宝箱中获得祸魂“丛云”
 
·离开藏前站，从2D地图前往浅草
 
·提示
 
坑道黑暗地带对策
 
道具“光玉”，600魔货，废品商店
 
魔法“光明术”，初期所持：下梯子之后出现在底下的Lv35地灵猿田彦、Lv28妖魔雷兽，学习：Lv38妖精巨魔（42）
 
坑道伤害地带对策
 
道具“浮空玉”，400魔货，废品商店
 
魔法“浮空术”，初期所持：Lv23魔兽巴芙·卡赫、Lv36圣兽朱雀，学习：Lv38魔神荷鲁斯
 
除了池袋坑道之外也会出现其他坑道，可以在阿玛拉深界的黑暗掮客处购买毗沙卡
 
刚来这个区域时是很难打倒4只鬼的，等练到Lv40以上就毫无压力了
 
【浅草-汤岛区域】
·只能移动到浅草
 
【浅草】
·设施：终端/邪教之馆/恢复之泉/废品商店（普通）：祸魂“涅槃”/“炼狱”
 
·第3劫中看过四骑士的剧情时，终端前出现魔人纯白骑士
 
战斗：vs.魔人纯白骑士（冰结吸收/破魔·咒杀·状态异常无效）：召唤天使力天使
 
对策：火焰·破魔无效仲魔、卡加/恩达系和全体恢复魔法
 
·打倒魔人纯白骑士后，获得“慈悲的烛台”
 
·在终端与圣交谈，在西侧B1F与逆剥交谈
 
·东侧B1F完成解谜游戏后（全20面）获得祸魂“禁忌”
 
·从东侧B2F出口前往御船代
 
，在御船代入口·门前与太洱交谈（无法侵入内部）
 
·返回浅草，在终端与圣交谈
 
·尼西罗机构第2入口已经可以侵入了，前往银座
 
·提示
 
设施集中，敌方恶魔在中途之前也不会出现，比较适合作为中期的据点